建立沿革:
護庇宮又名鹽水媽祖宮,根據廟志之記載,其建廟時間可遠溯自明天啟3年(1623),鹽水當地糖郊「崇興行」從大陸福建湄州朝天閣迎來一尊媽祖(即今所奉祀的開基三媽,又稱糖郊媽),併入福德祠合祀,並改為媽祖祠。
而據《諸羅縣志》卷十二〈雜記志〉之記載:「天妃廟:一在城南縣署之左.康熙五十六年,知縣周鍾瑄鳩眾建…一在鹹水港街.五十五年,居民合建.」
而據〈重興護庇宮碑記〉中所記:「月港之置天后宮也,于茲有年矣。康熙丙申歲,始擇其地,坐北向南,重興天后宮以成,且匾其額日『護庇宮』」
永曆16年(1662)鄭成功部將何積善率眾入墾,並將隨軍的媽祖入祠合祀,即今日的鎮殿大媽,後來鹽水境內日益繁榮,對媽祖之信仰尤甚,當時郊商又陸續自大陸迎來雜貨所奉之「箃郊媽」、由布商所奉之「布郊媽」及水、油商所奉之「水、(油)郊媽」等媽祖,另外由義竹鄉角帶圍商人迎來之「洲仔尾二媽」,同入媽祖祠合祀。至康熙55年(1716),境內信眾改建並定名為護庇宮。
乾隆4年(1739),曾修內殿,爾後,乾隆60年(1795)、同治4年(1865)、光緒4年(1878)皆曾崇修或改建。
日治時期,推行皇民化運動,日人強制廢除台民宗教信仰,護庇宮亦遭破壞,幸賴當時主事陳宗能搶救,才順利將媽祖金尊保存。
戰後,民國48年(1959)又再重建,並於民國61年(1972)竣工,成為鹽水地區居民之信仰中心。
護庇宮為鹽水的公廟,其祭祀圈可分為「大媽角」、「二媽角」、「三媽角」及「太子爺角」四個角境,各角境又分別由數個角頭廟所組成,祭典時遶境的範圍廣及現今鹽水全區。