本廟係創建於道光二十二年(1842)，由福建省泉州府同安縣，銀同人士來台共同捐資，位居於郡城內東安下坊溝仔底處為廟址，購買原同營會館僅存隙地為建地，主祀神明為天上聖母、保生大帝及文昌帝君。
昭和10年(1935)，適欉仔林朝興宮，因神社擴建而被拆除，所有神像均遷至本廟合祀，發起重修廟貌，民國34年第二次世界大戰期間遭盟機轟炸夷為平地，再於民國46年於原址復建，民國88年台南市政府因開闢道路，正殿被拆，民國91年用剩餘廟地重建鋼筋水泥建築，是為現貌。
銀同祖廟外觀 謝奇峰拍攝2011.7.9
銀同祖廟拜亭 謝奇峰拍攝2011.7.9
銀同祖廟大殿 謝奇峰拍攝2011.7.9
銀同祖廟拜殿 謝奇峰拍攝2011.7.9
銀同祖廟正殿神像 謝奇峰拍攝2011.7.9