建立沿革:
慈蓮寺主供釋迦牟尼佛，開山住持果淨和尚，號大願，俗名郭三，台南縣大內鄉明山村人氏，出家前與夫人郭施鑾英(出家後法號悟道)於新化經商，人稱郭居士。因殊勝因緣，於佛法上漸有領悟，郭居士秉持自利利人情懷，常為訪客開示佛法，率眾參訪寺院，領眾集結共修，贏得眾人愛戴，因親近者日增，為使大眾方便修證，遂有創建道場之議。
民國72年(1983)，郭居士伉儷於岡林村購得寺廟用地，由於岡林舊名滴水仔，且寺地位處盆地之中，四周峰峰相連，有如蓮花競秀，故地理形勢稱為滴水蓮花湖。是年，建置小平房一棟及搭蓋簡陋竹棚一處，作為週日道友共修道場。民國75年(1986)起，往來道場人士日眾，共修者、參訪者、慕名者不斷湧入，因空間擁塞，遂於當年八月搭建鐵厝百餘坪作為佛堂。民國76年(1987)間，郭居士伉儷相繼落髮出家，且將土地捐獻給道場。承剃度師父建議，道場命名慈蓮寺，取其慈悲喜捨、心性清淨之意。隨後即積極籌劃建寺工作。幾經研議，次第開發。民國80年(1991)始建大悲殿、觀堂、法堂、齋堂、寮房及闢建諦觀園，於82年(1993)完工。88年(1999)再興築正觀大樓、禪堂、迴廊等，隔年落成。民國90年(2001)於佛堂原址興建佛寶殿，成今日之貌。