建立沿革:
噶瑪噶居寺乃佛教金剛乘噶居傳承在台灣的第一座叢林寺院，籌劃啟建於民國74年(1985)。
據〈台南噶瑪巴僧院紀念碑文〉之記載：
「初學道本於民國七十七年十月皈依三寶，並經尊貴的創古仁波切剃度受沙彌十戒，以弘法利生為己念，丁卯年(一九八七)兼承佛命，開山創建噶瑪噶居寺，做為大寶法王之道場及傳續法統之聖地，故興建之初即依西藏傳統之外觀及規劃，供為承先啟後之典範，自僧院建起，遂期完成全部工程。
「無上噶瑪噶居傳承前蒙貢噶佛爺法裔貢噶老人宏開續傳於台，後經四大法王子及諸大仁波切屢次蒞台傳法，乃更昌盛，惟正式寺院在北僅貢噶精舍，目前在南亦僅 本寺而已。尤本僧院之興建幸蒙十力善信全力捐輸，慷慨解囊，工程如期進行，另外尚有陳大雄建築師的義務規劃設計，與道本共同監造，致本院在物力維艱情況 下，有賴三寶三根本之加被及龍天護持，得以順利興工，預計於七十八年底全面完工 「今佛剎規模初興，除感謝十方善信外，并願叢林永懋，佛法長興經塵劫而不朽，是為誌。道本敬題。中華民國己已年(一九八九)臘月。」
噶瑪噶居寺的住持洛本仁波切(道本)，民國77年以前和時下年青人沒兩樣，即便出家後仍覺得自己是平凡的僧侶。八十年初有人告知其為轉世活佛，前兩世都是西藏喇嘛，方才如夢初醒，成為在台漢人第一位轉世活佛。
俗名魏呈祥的洛本仁波切，是台灣第二位被發現的活佛，其家世簡單，父親為閹豬師傅，母親從事縫紉修補，童年及少年生活貧苦。洛本仁波切於二十六歲時宗教逐漸在他的生命中佔據重要的地位，當他在台北營商而有小成時，出家的意願更顯強烈，至二十八歲時出家，法名「道本」。
民國八十年初來自錫金隆德寺的夏瑪佛爺，發現台南縣左鎮鄉的密宗道場噶瑪噶居寺，興建情況異常順利，乃進入定中觀察因緣，發現住持道本(洛本仁波切)竟是密宗白教的一位轉世活佛。80年9月道本法師到錫金隆德寺，接受坐床大典，成為洛本仁波切，正式繼承密宗白教噶居(舉)派弘法要職。
噶瑪噶居寺是藏傳佛教(白教)在南台灣的重要且唯一的道場，腹地廣大，寺院分佈著香光院、大寶法王殿、文殊院、舍利塔…等建物。
參考資料：
噶瑪噶居寺官方網站http://www.lopon.org.tw/visit/index.asp?show=visit_002_001.html
《台灣佛寺導遊(九)台南地區》，闞正宗，菩提長青出版社，1997。