建立沿革:
台灣光復初期，漁民生活困苦，居民紛紛前往府城謀求生計，並群聚於舊漁行附近定居。民國五十六年首先由施風調回家鄉下茄萣金鑾宮恭請三媽祖回府膜拜，三年後旅居府城鄉親施風調、郭江海、吳添福、薛順興、薛榮吉、薛石龍、薛水用、施定、王源助、林天可、施金豹、薛慶瑞、郭義雄等十三位組織團隊，回祖廟與董事會商議，虔誠求得天上聖母之聖意，以擲杯決定三媽祖駐鎮府城，四媽祖駐鎮港都。
聖母移駕府城之初，每年均以擲杯方式，選出輪值爐主為鳳鑾駐所，祈求出外子弟闔家平安。民國六十二年，爐主薛山掌、莊登燦、薛江溪等人，認為聖母每年移駕，並非長久之計，遂有設壇供奉之念。但因當時信眾們經濟拮据，苦惱無力負擔設壇經費時，幸由漁業界聞人黃金印指派黃士銘参與發起人會議，並慷慨解囊，協助雕塑大媽祖金身，自此設壇經費終有著落，同時，亦取得吳添福同意，無償借用其厝供媽祖設立行館，並於當年成立金鑾壇(又稱三媽壇，今台南市府前路二段230號所在地)。民國七十三年，為配合政府打通府前路騎樓擴建行館。
數十年來，聖母降臨顯化，保佑鄉里信眾平安，香火鼎盛，聲名遠播，靈感神蹟不勝枚舉。有鑑於設壇之地點已向吳添福借用三十餘年，且因參拜者日益增多，空間不敷使用，為感念神恩浩蕩，發起購地建廟，經熱心信徒積極奔走、協商購地事宜，終克服萬般阻力，於民國九十三年經三媽祖選定佔地一百三十二坪，聚氣呈祥，寬宏地理之現址作為建廟用地。由媽祖指派黃士銘籌備計畫，極力推行建廟工程，而各項工程在精研細算，且幸於國際原物料大漲前夕順利完成發包作業，於民國九十四年農曆九月一日辰時動工興建。本工程期間，經各信眾群策群力、戰戰兢兢，努力完成每一階段工作。由於全體十方善信萬眾一心，鼎力相助，工程乃得以如期圓滿完成，於民國九十九年農曆二月二十日亥時入火安座大典。