建立沿革:
神農殿主祀神農大帝，由鹿陶開基祖北極殿分香而來，早年在楠西設鄉之前，由於龜丹村鄰近玉井，龜丹村民都會到玉井鹿陶的開基祖北極殿祭拜，祈求廟內神農大帝庇佑村平安、五榖豐收。但由於路途遙遠，祭祀不方便，所以在民國18年(昭和4年、1929)，由北極殿分香到村內。
最初設立於龜丹頂，為茅草小祠，後遷至福德祠旁，由於龜丹溪溪水湍急，村民要祭拜往往要涉溪，甚感不便，民國30年(1941)，信徒遂擇定龜丹溪右岸的現址，興建土角公厝，將神明奉請來此，民國34年改建為磚造廟宇。
民國83年，由於神農殿年久失修，多處漏水，修繕不易，經管理委員會與信徒商議後決定重建，並於85年(農曆84年)動工，至88年(1999)完工。