建立沿革:
麻豆鎮保安里「保安宮」，廟號始禒：保寧宮。初址座落於古麻豆社虞朝庄新店角（麻豆港水堀頭碼頭西側，即今麻豆代天府廟址）。始建於明朝永曆十六年（西元一六六二年）。初祀 李府 池府 吳府三尊千歲，香火鼎盛一時。 前清乾隆中葉（一九六○）以降，麻豆港航道陸浮。虞朝庄因失海運功能，人丁漸次星散。斯時：保寧宮香火難繼，千歲神尊因之易狩他鄉。由虞朝庄順倒風內海麻豆港、經麻豆海埔、巡狩至北門王爺港。經當地漁民柯馬義（一七四三～一八四三，今北門鄉溪子寮五房始祖）恭迎上岸奉祀。次後每年農曆三月末日，神尊循例回鑾麻豆駐蹕一月。次即有清一代以迄近年（一九五六）麻豆舉開「迎香祭」之由來。
自乾隆末年以迄嘉慶年間（一七五五～一八二○），麻豆繁華街市由水堀頭西移。道光十九年（一八三九），麻豆街衢析分為：頂街（穀興街）與下街（穀興街）。是時；保寧宮 神尊回鑾麻豆祖廟行宮，隨街市之發展，由虞朝庄暫遷麻豆庄穀興街（今保安宮廟址路南，廟向坐南朝北），廟稱：王爺宮。
咸豐七年（一八五七），麻豆庄耆紳林朝榮（林家二房祖，誥授奉政大夫。一八一二～一八八五）與大埕角富紳李約（一八一四～一八六五）倡議，將神尊臨時行宮，遷建於原址路北，嗣增祀 朱府 范府兩尊千歲，廟號：五府王爺宮。日治昭和八年（一九三二），麻豆街市改正，前殿拜亭因街路拓寬，逐遭拆除。民國三十五年（一九四六），地方政制改隸，本廟隸屬保孜里轄區，廟號改稱：保安宮。
民國四十五年（一九五六），神尊循例回鑾麻豆。農曆四月初旬，巡狩至關帝廟角，神尊曾駕青龍，宣示王諭：水堀頭地靈回復，鑾駕意將永駐麻豆。因神靈顯化昭彰，地方同沐浩蕩神恩，研議重建「保寧宮」神庥。是時；台灣施行戒嚴，無從議建新廟，乃籌組「麻豆鎮保安宮遷建委員會」，以「遷建保安宮之名」行「重建保寧宮之實」。於完成階段性任務後，廟號析分：「麻豆保安宮」與「麻豆代天府」兩座神庥。
回溯本廟，自明末清初肇建以還，綿延迄今，已三百有餘年。鑑古知今， 天地有陰陽之德，古今有顯晦之機。建一廟必敘一廟之緣由，以表彰其大德。立一宇必記一宇之來歷，以顯著其宏功。本廟曾數易廟址，幸神靈赫濯、威儀遠播，終能根深葉茂，馨香不替。