建立沿革:
紀元十五世紀之前，曾文溪〈昔時為灣裡溪〉未改道之之初，台江沿線即是西拉雅族人所屬平埔族的發蹟地，而土壤豐腴肥沃、平坦廣闊富有水草之北頭洋，番仔寮，即為平埔族人所墊居墾殖。及至明末國姓爺鄭成功克台，據此為反清復明作基業，於其「寓兵於農」之政策下，乃分配鎮兵楊文科來此屯兵墾田拓殖，此為漢人來此拓荒之鼻祖。清康熙十三年〈西元一六七四〉再有楊文允公原籍福建省漳州府海澄縣第三都新恩里新安堡霞陽社，移居台灣府嘉義縣安定里西保蕭壠庄北勢山寮居住〈番仔寮〉來此參與開墾繁衍，成為番仔寮楊姓始祖。
雍正十二年繼有唐山祖地居漳州府海澄縣之楊姓、陳姓、謝姓等先民，先後攜眷、奉請家鄉之神祇「保生大帝」、「關聖帝君」、「呂山通使」及楊姓祖神，渡海來台，於此墾屯定居；當時僅築草寮為廟奉祀，偶有疾病禱之即不藥而癒，因而香火鼎盛，雖尚未正名，已是楊姓族人及拓荒聚眾之精神信仰寄託。乾隆三年〈西元一七三八〉遇颱風摧襲，簡廟頹損，崩塌之勢，朝不保夕，遂籌資鳩工再建廟宇，安座奉祀。
清咸豐四年〈西元一八五四〉授軍功七品之楊應孝公〈楊文允公曾孫〉，有感諸神聖及祖先神位屈居陋室，未有正名之敬堂以安祀，乃召集各房耆老協商募款籌建正式廟宇，並襲用祖籍之「應元宮」為名，以昭來台始祖功績及期勉後世子孫光前啟後之意，坐東朝西之正名殿堂於咸豐七年〈西元一八五七〉三月竣工入火安座，並舉行慶成祈安清醮。
於來茲墾荒拓野之時，有祖籍海澄縣霞陽社後頭角〈應泰鄉〉人楊應老、楊傳受三兄弟經營農產品：甘蔗製糖〈草部〉及〈酒沽〉製酒工場等頗具規模成就，當時清廷於台，政事不彰、治安不力，致而到處聚眾起事叛亂攻擾，山賊群起劫掠民財，強暴姦淫、放火殺人等情事時迭頻繁，有鑑於此，乃由唐山聘請文武名教師來台，開文館授課，立武館習武，集齊全庄壯士組織義勇自衛隊，傳授各種拳術、武器、陣法，精習攻擊防衛之武略，來保護全庄人民性命財物之安全，此乃鼎鼎盛名「番仔寮宋江陣」之起源，尤以嫡傳第二代之楊應孝公武技更著譽出眾，入軍旅參加各戰役，屢立功勳，蒙朝廷頒授軍功七品銜，此後承襲傳續之宋江陣武術傳習者，秉持發揚光大之精神，紛紛受聘至各地開館傳授武術及宋江陣法，於同門同色「腳巾」之殷證下，門下師生可謂遍佈南台灣，且歷經二百餘年，本地宋江陣至今源流傳承不息，永續先民之治，至今傳有七代；至於民國前之蕭壠香，本質所組成出陣之「打臉宋江陣」曾是刈香陣容之一大特色，更表現其威武無比、剛猛凌厲之氣勢。
然歲月悠悠，地形水路地理環境之自然變移，廟貌日益斑剝，至民國十二年〈西元一九二三〉楊忠獻公與楊金榜公等協商，由諸公發起第二次籌建會，決議改建，重新堪輿，始定位坐北朝南，於民國十六年〈西元一九二七〉完成竣工；後經日據時期，日軍暴力統治，嚴禁宗教信仰，燒毀神像神器，對寺廟恣意摧毀，廟貌摧殘殆盡，辛於民國五十二年〈西元一九六三〉由楊新迪公發起重修籌募整建，並興建拜亭；而今，金碧輝煌之廟殿，外貌觚嶙聳屹，係於七十年〈西元一九八0〉八月由楊炳連公為首之第四屆籌建委員會，有感於架椽樑門之杉木，年積月累，已見腐蝕斑斑，為光前人基業及報答神明庥佑之恩，群集地方碩德群策群力，敦請時任縣長楊寶發宗親於同年十月二十五日動土興工，宏模初具未幾，連炳先生積勞謝世，又公推楊添丁先生領銜籌建事宜，經籌建會諸公公而忘私、任勞任怨，卒於民國七十三年〈西元一九八四〉一月二日竣工，恭請時任臺灣省議會議長高育仁鄉親及台南縣長楊寶發宗親剪綵，並舉行入火安座大典，尤以七十四年〈西元一九八五〉十月二十五日舉行之慶成祈安大醮，地方人士興高綵烈、熱鬧轟動一時，真是人神共奮。另以舉辦中斷五十餘年之「丁卯年蜈蚣繞境大遊行」，迤邐公里的蜈蚣陣，更使醮典盛況空前；此蜈蚣環廟之遺旨，更使傳統之蕭壠香蜈蚣陣精神再現，以宋太宗皇帝出巡，真宗、仁宗三代計八十八年之王侯賢臣、聖哲先賢，得道仙人及忠貞義士、烈女等人物為主，涵蓋盛宋時期之所有菁英，又有蜈蚣珠的一百零八員蜈蚣陣，雖與金唐殿香科因緣際會，未再重新組合出香，卻也轟動各廟壇，其驅邪逐魔、清靖鄉里，保佑百姓庶民安居樂業之基本精神，會與番仔寮蜈蚣陣美譽，傳承不絕永為後世所讚頌嘉許。
本宮自開基祖建業以來，歷今已參百餘載，曾經蒼海桑田經亂賊災難，均蒙神靈護佑，化險為夷，自始即香火鼎盛，廟貌一新再新；中殿主祀保生大帝、二郎神君、呂山通使，右殿配祀天狗將軍，左殿配祀福德正神等諸神佛，慈懷神澤浩瀚神恩「應」是番仔寮人的信仰中心，而後殿奉祀楊姓先祖牌位，「元」是祖德留芳蔭萬世表徵；藉此簡介，殷期後裔俊秀，體念創業之艱辛，更懷以光宗耀祖敬報神恩之使命感，光大基業使「應元」傳統精神永垂不朽。
節錄『台南縣董楊宗親會第七屆第三次會員大會‧慶祝成立二十週年慶暨祭祖大典大會手冊』、民國八十八年十二月十九日─
簡介與相關圖片:
應元宮廟貌正面(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮廟貌側面(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮廟內(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮廟內神龕(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮後殿楊氏祖祠(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮楊氏祖祠恩元匾(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮福德正神(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮虎爺(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮奉祀神祇表(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮應元宮史誌(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮天狗將軍(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮天狗將軍(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮田府都元帥(周宗楊攝影2011.05.28)
應元宮宋江陣兵器(周宗楊攝影2011.05.28)
祭祀活動:
農曆3月15日保生大帝聖誕
謝大戲，酬神
應元宮組有一百零八節人力肩扛蜈蚣陣，史上三次出陣紀錄：
民國元年佳里金唐殿壬子香科裝扮十八瓦崗寨起義，唐太宗李世民與薛仁貴征東的故事
民國二十二年（西元一九三三年），裝扮內容為三國演義劉備出巡之故事為主，此次繞境遠征至西港慶安宮，就此奠定番仔寮蜈蚣陣的美譽。
民國七十六年（西元一九八七年），舉辦的「丁卯年蜈蚣繞境大典」，，當時是以宋太宗出巡為主體，由一百零八位神女、仙童裝扮成忠良義士、文武百官。
預計民國一百年底拜庭慶成謝土時會再出動百足真人蜈蚣陣
應元宮組有宋江陣最早可溯及到嘉慶五年