建立沿革:
康熙57年(1718)建靈濟殿是安平港仔尾社境主廟，主祀保生大帝、伍府恩主公、玄天上帝、水仙禹帝等神祇。
靈濟殿原名仙史宮，相傳康熙18年(1679)安平漁民二百人共乘六十隻漁船出海撈魚，突遇強風暴雨，澎湃怒濤，其中三十隻之漁民被吹沉沒，殘三十隻漁民在與怒濤生死搏鬥，危及萬分之際，共鳴祈禱神明護佑，然後在遙遠之地方見提燈，顯明伍府恩主公之記號，該三十隻漁船乃依照光明之方向進行，到達澎湖島望安鄉，並分其香望安仙史宮總制安寧王伍府恩主公雕奉金身，並於康熙57年(1718)建廟「仙史宮」。日治時期開闢運河，慈濟宮遭拆除；北極殿，也因開闢馬路，遭到拆除的命運。於是慈濟宮的保生大帝、北極殿的玄天上帝，皆移祀仙史宮，廟名重新取用總制安靈王的「靈」、慈濟宮的「濟」、北極殿的「殿」，將廟名改稱為「靈濟殿」。