聖南寺位址在清水鎮鰲峰里19鄰大街路84號，創建於1958年（民國47年）落成，原主祀神孚佑帝君乃分靈自木柵指南宮，1995年（民國84年），現任住持就任管理廟務之後，將原廟號「聖南宮」改為「聖南寺」，現況經營並無年中重要祭典，平日仍供信徒焚香祭拜，但主要以僧侶自我修行為主。