建立沿革:
「屏東古早是阿緱，萬丹街仔頭」，這句三百多年前的俗語，道出屏東及萬丹的來源，也說出萬丹在當時的重要性。
明鄭末年，先民渡海來台，輾轉到萬丹開墾和經商，由於萬丹地勢高於週邊的土地，且與上、下淡水社的平埔族村落接近，因此就在此定居下來，以它做為跟平埔族買賣的地點，之後，此地漸漸形成一個買賣交換物品的小市集。
萬丹一詞最早出現在康熙23年「台灣府志」上，距今已有三百多年，在康熙35年前，萬丹就已成街了，雍正九年更成立萬丹縣丞署，是鳳山縣的分縣，統治屏東平原。
而「萬丹」一語是平埔族的話，古代鳳山八大番社「上淡水社」，「下淡水社」及赤山庄的平埔族都住在萬丹平原，萬丹是馬卡道族（平埔族）語，意為市集買賣之地，跟閩南語的「街呢」一樣，所以當時上、下淡水社的平埔族人，如果要去這個小市集買賣物品，就說「要去『萬丹』」，意思就是要上街去做買賣。
萬惠宮肇建於乾隆廿一年九月，公元一七五六年，位於屏東縣萬丹鄉與竹田鄉介於東溪、西溪兩溪地區，據說是在萬丹街內龍舟內的龍肚位置上，古老萬丹人認為它可以庇佑萬丹人的財富，盈聚錢財，是三十六閩南村落共同信仰的宗教中心。據乾隆廿九年曾有片段記載：「萬丹街有一天后宮。」此為萬惠宮的前身，且據說：「乾隆初年，天后宮的地方，住有一對從唐山來的補鼎夫婦，有一天晚上，中街地區的住民，看到天后宮的地方，佛光萬丈，於是就過來看看，沒想到那光芒是這對老夫婦所奉拜的媽祖金身發出的，所以之後就留下供大家膜拜，這是天后宮媽祖的來源。」
萬惠宮可說是歷史悠久的古廟，至今也有二百多年了，歷經地震兵燹而重修多次，尤其是在民國十九年十月，鄉紳李南、李開胡父子兩人籌募重建萬惠宮那次。由於李開胡藝術造詣較深，因而由他負責重建的萬惠宮，偏重於藝術文化的價值，如萬惠宮兩旁的賽台，都是巴洛克式的西洋風建築，造形相當的優美，它古意盎然，飛簷翹楚的剪粘，都是台南洪順發大師所砌建的，尤其龍的神韻造形，無人能出其右。
另外值得一提的，就是當時李開胡還禮聘兩位風格不同的木雕大師，台北的黃龜理和唐山廈門楊秀興，分別為廟宇樑柱雕琢彩繪，並在主持雕刻典禮時，用墨斗準繩自廟宇中間劃分南北二邊，中央掛起白帆布，讓黃龜理由北邊雕刻，楊秀興由南邊雕刻，彼此互相較勁意味濃厚，雙方各憑本領、盡展其藝，將自己最好的作品都雕琢在萬丹媽祖廟的廟宇上。
到後來雙方對台而不睦，於是便在橫楣插角彎界楣上，彼此盡雕刻一些挑釁對方的歷史戰爭典故，如大門口北邊的橫楣龜理師以許褚戰馬超，比喻兩看誰最神勇，楊秀興亦不甘示弱，以九曲黃河陣，比喻雙方各憑實力顯神通。進入三川門南邊刻有哼哈二將顯神通，比喻有什麼功夫儘量施放過來。北邊刻有左慈戲曹，含有戲弄對方之意，進入後殿槽井人物彎弓楣，南邊的大雕刻師楊秀興刻有水淹金山寺比喻對方完了。北邊的龜理師雕刻有聞太師行到龍嶺，比喻對方也走頭無路了。
使得整棟廟宇的橫楣插角木雕部份，雕刻戲齣熱鬧非凡，據後來黃龜理大師回憶說：「萬惠宮重建時，兩邊大小師徒各有數十人，常發生口角鬥毆。有一天香爐忽然發火，眾善信扶乩請示，媽祖告誡：「下午申時，希望主事阻止南北兩邊雕刻師父互相打架。」由於兩邊雕刻技師，因長期對立，積壓怨氣以久，果然當天下午四、五點，互擲雕刻工具，把帆布都割破不堪，人員也受了傷。若非媽祖扶乩預警，及時阻止雙方互毆，才使建廟工作得以順利完竣。」
因此他對萬惠宮印象非常深刻，萬惠宮落成後，楊秀興也回到唐山不再到台灣來了。
所以廟口屋簷的吊筒，一邊是紋路粗獷有力，人物神韻栩栩如生，一邊是精緻華美、細膩傳神，各有不同的表情風貌，有本土傳統的民間故事，也有西裝革履、打著領帶的洋人，更有裸露上身的西洋女神，在厝角上雕有戅番扛厝角，戅番中有本土番也有西洋番，表情風貌各有不同。
因此萬惠宮竣成後，台南以下要蓋廟的大師都要到萬惠宮來觀摩。萬惠宮媽祖廟不僅是萬丹，而且是全屏東縣地區，最有文化藝術價值的廟宇，更是萬丹人最引以為傲的藝術殿堂。
只可惜，在最近的這次重修中把原本擁有巴洛克建築樣式的兩側樓房（賽台）給打掉，整個外觀變得較富麗堂皇，但沒把原有的建築保留，還好，在廟裡面的雕刻藝術有保留下來，這樣的雕刻有著不協調，卻又完全的相容在同一空間，讓這廟有著與眾不同藝術價值。
此外萬惠宮媽祖顯靈的故事，時有所聞，尤其是在民國三十四年（公元1945年）第二次世界大戰爆發期間，盟軍飛機不斷來台空襲轟炸，就在二月二十日上午十一時左右，數枚重達五百公斤左右的炸彈，投擲在人口稠密的萬丹街內，幸好引爆者甚少，其中有一枚炸彈落在萬惠宮旁邊，衝破十一層屋壁，最後落在李同益 先生粗糠間內豎立著而沒有引爆，否則後果不堪設想，而當時傳言說：美軍投下的炸彈，是媽祖顯靈化身成美女，用雙手去「拿炸彈」，炸彈才沒有爆炸，而飛機駛員看呆了，飛機掉進下淡水溪去了。事後鄉民到媽祖廟拜拜時，看到道光年間雕刻的媽祖赫身，竟然雙手大拇指都斷了一小節，食指也受了傷，善男信女請示聖母，扶鑾借乩，媽祖降示：「因為空襲，顯靈化身「拿炸彈」， 不小心手指才受傷。」由此更加印証媽祖顯靈的事蹟。
此事傳開後，媽祖顯靈的神蹟傳播千里，高屏各地善信女，都到萬惠宮來頂禮膜拜，香火鼎盛，大家都要一睹萬丹媽祖的神采，其未爆炸的炸彈殼，也放在萬惠宮廟前供人觀瞻。
資料來源:台灣大百科 http://taiwanpedia.culture.tw/web/content?ID=22540