建立沿革:
根據老一輩傳述,在清代有一位嘉義布袋姓石、馬兩位人士,到東港今崙仔頂一帶開發漁塭養魚,後年邁仙逝,因未有家室莊民遂將其埋葬在附近,因而得到地理良穴,時常顯靈幫助養殖漁業與附近居民,後石大姓公顯靈交代附近居民幫助其建廟奉祀,居民聞訊出錢出力搭建草廟,於清代某年的農曆三月二十八日入廟安座。
後清末時期在改建石磚瓦礫廟體,又某年崙仔頂海域飄來一座傅姓的祿位牌,有民眾將其撿起寄放於三姓祠,後據石姓公降駕指示,祿位牌之主乃傅姓秀才,石姓公與他已結拜成為義結金蘭兄弟,故地方人士稱之為三姓公,將其廟尊謂為「三姓祠」。
由於三姓祠廟體自清末至八十年代已百年時間,廟室狹小又年久失修,管理委員會決議重建,終於民國八十四年(西元1995年、歲次乙亥年)完成,並擇良日舉行入火安座。