建立沿革:
「台灣府志」19卷,寺廟篇載:「水仙宮清乾隆4年(西元1739年),建於諸羅縣笨港街」,迄今已200餘年。水仙宮主祀「水仙尊王」,或簡稱「水仙王」,先民以有關水利、河航等皆為其所轄,因此沿海居民、漁民、貿易商人崇信,並建廟奉祀,祈禱航運平安,本宮神像依次為-禹帝(大禹)、楚王(項羽)、伍盟輔匠(伍子胥)、屈大夫(屈原)、魯師匠(魯班公)等,皆有功於水,儼然水中仙也,因而欽之為王,其左、又侍從為「羿善射」尊者、「奡盪舟」尊者。水仙宮因神威顯赫,香火鼎盛,至清乾隆45年(西元1780年),貢生「林開周」倡議拓建完成,是時笨南港尚有「協天宮」奉祀「關聖帝君」及「天后宮」奉祀「天上聖母」。規模宏大,併為笨港勝蹟。清嘉慶8年(西元1803年),笨港溪洪水氾濫,街民房屋流失不計其數,水仙宮、協天宮,二廟同遭洪水之災,事後地方起鳩資購材,於清嘉慶19年(西元1814年),擇於笨南港街即今現址,重建水仙宮復振香火。清嘉慶21年(西元1816年),笨港縣城龐周獻匾「日月爭光」,直到清道光28年(西元1848年),笨南、北街廈郊金正順、泉郊金和順、龍江郊金晉順,三郊發起捐資建後殿,奉祀原協天宮「關聖帝君」神像,自此成為二廟合一,其後歷近百年,受風雨侵襲剝蝕,民國36年(西元1947年),由地方募款重修,歷時3年完竣,本宮煥然一新,民國74年經內政部核定為國家二級古蹟,76年遭颱風侵襲,經政府撥款修護,於民國80年完成修護工程即今廟貌。