建立沿革:
本宮原名呂仙祖樸靈公廟，俗稱樸仔公，奉祀主神為呂仙祖及樸靈公，據傳於光緒年間有抗清反日之列士為民赴難殉節者，馬革裹屍於荒郊野外，失之收埋，令人不勝概嘆；民國元年（歲次壬子年）秋，有東石賣菜販吳姓生意者，避雨於樸樹下，忽聞香風陣陣發於樹底，心知有異合掌默禱。不及二、三年生意順利家道昌隆，遂主倡建一小廟宇於樸樹之後，曰「樸仔公」。繼而四方響應靈蹟常昭香火鼎盛。
民國十三年（歲次甲子年）初夏，該廟祝夜夢頭戴九粱巾，身穿八卦衣著，笑之曰：「此廟應堆山石以受萬民禮拜必有好處」，未幾，忽有抱呂仙祖金身者要求祀於廟裡，聞係唐山人理髮者莊其勇由鯉湖請來之金身，於是安爐座殿，神威顯赫遠近均信徒求祈庇佑者無不應驗。先是海通路初開，因廟宇迫路確有交通不便之危險，日本巡查屢迫拆毀均被責罰，故未敢損其片瓦耳。廟口距路僅數尺日日車水馬龍紛紛往來，但數十年來未聞發生車禍，此莫非神之護裨也，民國四十八年端午節過後二日，廟祝邱助先生與會計主任黃傳心先生商洽，見廟庭樸樹日見枯萎，莫非神欲移居乎，即焚香求筶，果得三聖，惟慮無地遷建，當時廟後有一大榕樹枝葉蒼翠覆蓋達十餘坪地，若神有靈何患無廟地，越日上午八時頃遽聞風聲如雷，其樹竟連根拔倒，鄰近無不感其靈異，於是決定購地興建，同年地方人士組織遷建委員會，由蘇坑先生主任委員鳩工庀材卜吉興工，樂捐者爭先恐後接踵而來，未始非神之靈異應感召也。
民國六十三年（歲次甲寅年）完成一、二樓（現今樸靈宮），一樓辦公處，二樓奉祀呂仙祖及包府千歲，未幾再增建三樓奉祀天上無極王母娘娘，民國七十年九月九日信徒大會決議通過更名為「樸靈宮」，至此規模壯麗俎豆馨香萬民受被無疆矣。
註:摘錄於朴子市公所宗教資訊網