根據《嘉義市志 卷十 宗教禮俗志》所記載,南遊宮創建於民國35年(《台灣省嘉義縣市寺廟大觀》記載為民國40年8月創建),原於日治時期由本地人奉請朴子配天宮天上聖母來此地。後來又陸續請來鹿草鄉中寮村安溪三城隍及新營太子宮中壇元帥。本宮於民國65年重建。