鹿耳門聖母廟管理委員會指出，民國50年（1961）辛丑啟建首科香醮，之後每逢丑、辰、未、戌年農曆3月，3年一科，舉辦盛大的「鹿耳門媽香．五府千歲醮」。
每科香醮，第一天請王，第二天起連續3天舉建禳災祈安清醮與刈香遶境，第五天送王。管委會指出，媽祖出巡時，各村莊文武陣頭陪同「媽祖遶境」，包括宋江陣、八家將、蜈蚣陣、金獅陣、白鶴陣、牛犁陣等場面浩大。
民國101年壬辰年又適逢3年一科的「土城仔香醮」，廟方成立壬辰科香醮辦公室，日前擲筊選出香醮大主會、主醮、主壇、主普、三官首的部落，分別是下什份塭、港仔西、鄭仔寮、土城角、郭岑寮，再從部落人選中選出各主會爐主等，全面展開籌備3年一科香醮活動。
新聞來源： 聯合電子報 2011.11.07
新聞網址：http://udn.com/NEWS/DOMESTIC/DOM5/6700851.shtml