龍興宮主祀哪吒三太子，確初創建年代不詳，創立之前，員貝的信仰中心為鎮海福海宮，相傳因交通、奉祀迎送不便，約在咸豐年間(一說道光或光緒)分靈鎮海福安宮三太子爺香火自行建廟，據聞當時建材均由村民自家小船搬運，或海邊撿拾沙石，家戶輪流協助小工。
依廟中文物，光緒年間或有重修，其餘失記，民國55年(1966)重建，民國81年(1992)曾整修，至民國91-93年(2002-2004)再次重建為今貌。