據日治時期及民國48年（1959）調查表記載，創建於同治2年（1863），由趙姓人士發起興建，秀才出身陳澄湖等及其後代出資建宮，日治時期曾重建；民國60年（1971）鄉老陳歷發起修建，為潭邊之次廟。民國89年（2000），水仙尊王以發爐預示，遂有重建之議，迨至民國92年（2003）落成。
潭邊聚落西側為潮間帶、石滬滿蘊藏著豐富的魚、蝦、貝類等大宗的海洋資源，建宮奉祀水仙乃庇佑村民在這片海域作業，能平安無事，且祈求有豐盛的海產供聚落村民捕撈，改善生活。