西佛寺原是山水里民陳國上的私人佛堂，稱為「開靈堂」，日治時期以打石為業的陳國上久病纏身，病癒後開始篤信佛教。民國50年（1961），陳國上利用自家民宅開設「開靈堂」，聚集信眾來禮佛；民國62年（1973）山水里民陳清平由於家族長期吃齋，在開靈堂協助相關事務。
一開始信徒都是自家親戚，陳國上過世之後，陳清平拜在釋潔淨門下（法號沅定），並接掌開靈堂。釋潔淨曾為紅羅開蠻寺和西溪西泉寺住持，後將佛法傳到山水。
民國74年（1985），開靈堂的信徒與日俱增，佛堂空間不足，因此由陳清平發起，於今址興建一座佔地200多坪的新佛堂，民國76年（1987）11月竣工，取其由西泉寺分枝之意，命名為「西佛寺」，而西佛寺的觀音佛祖則來自開蠻寺。
陳清平一家在當時支持火化，民國78年（1989）由45位信徒合資在西佛寺旁興建靈骨塔「陵巖塔」，至民國95年(2006)，因原西佛寺損壞，空間不敷使用，改在陵巖塔東側另建新寺，即為今貌。西佛寺除一樓為地藏殿外，二樓皆為納骨空間，是澎南重要的殯葬之所。