相傳於200年前由清真寺蛻變而來,清康熙末葉閩人郭瓊渡海來台草創一座清真寺於洋仔厝溝之陽,廣收明朝遺民之士。雍正十年(1732),清廷派密史金瑞會同鹿仔港巡檢王鴻仁興兵勦滅、焚寺,明朝遺民之士殉難併波及居民。民國40年,馬府元帥顯靈指示重建,並經廣澤尊王親覓現址蓋廟奉祀,立寺名為長安宮。民國66年遭祝融之災,再次於民國69年重建之。