據傳三百年前有一婦自大陸攜一尊聖母金身至荷包嶼奉拜。初搭草寮，至同治八年改建為土角廟，自北港媽祖廟分靈建祀。安平宮於光緒年間經三修，迨民國46年重建，民國69年重修內部，70年新建牌樓，72年蔡寬發起建築鐘鼓樓。民國74年改建兩側廟室，一、二樓已告竣工。
由牌樓柱聯上可看出安平宮之精神所在，旨在宣揚神威，護鄉愛民，而實際上本宮廟時常協助社區改善生活環境，推動端正禮俗等公益活動不遺餘力。