朱玄宮主祀朱府二千歲，據廟碑記載，朱府二千歲乃因早年往返台海、庇護航行順利平安之守護神。民國83年(1994)地方耆老趙丁發捐地(即昔日糖郊崇興行遺址)建廟，翌年動工，至民國87年(1998)竣工落成，為今日之朱玄宮。