清水宮主祀清水祖師，據傳清水祖師乃沿自清朝年間，當時有位唐山人來歸仁南保工作，工作完畢欲返回鄉時，神像竟自動跳出行李箱，經請示後，原來清水祖師意旨留在台灣，於是遂將其留置當地黃姓人家內供奉。
戰後，清水祖師因神靈顯威，信徒日增，而成為當地公佛，由庄民輪流安位奉香。後來由時任村長黃智捐地，建造簡易神壇，於民國70年(1981)募款重建，並舉行首次建醮；爾後經過十餘年，於民國81年(1992)再次修建，名為「清水宮」。