慈天宮原為新化大厝內黃氏家廟，據廟志記載，黃氏先祖原居福建省金浦縣，後追隨鄭成功軍隊來臺墾殖，黃氏宗族在此供奉觀音佛祖，初時輪祀於民宅，後因感不便，信徒於民國63年倡議建廟，於戊午年(民國67年)完成，後再增祀五府千歲。