清乾隆嘉慶年間始有先民來此設閘捕魚，稱為「五間閘門口」。後陸續洋寮仔、八股仔、溪南寮仔等聚落形成，光復後稱為「溪南村」。
道光乙巳年庄民至南鯤鯓分靈李府千歲，是為開村之神。台灣光復後將日語講習所，恭祀諸神，民國五十七年(1968)建中山堂，做為集會之所亦祀神明，民國七十二年(1983)，始建廟宇寶龍宮。