開基中軍宮主祀中軍府，乃自庄內另一座中軍宮(德崙路77巷118號)分香而來，據《仁德鄉志》記載，中軍府最初乃本庄邱姓道士（紅頭師公）之先祖於土地公庄撿拾到神像及香爐，請回邱家奉祀，原輪祀於民宅間，後地方曾、陳、邱等三家族共同商議醵金建廟，爾後因廟內委員意見紛歧，遂另分香建廟，名為開基中軍宮。