清康熙五十八年(1719)由百官捐俸建鹿耳門媽祖廟，後因清道光年間遭洪患沖毀，聖母等諸神像寄奉台南海安宮，並在水仙宮寄普，至日據時代民國七年﹙一九一八﹚始迎回至土城保安宮奉祀，迨民國七十年三建鹿耳門聖母廟落成安座，並正名為「正統鹿耳門聖母廟」。