本宮肇建於清朝嘉慶七年〈西元1802年〉，迄今已達202年，早期從左營桃子園庄清雲宮迎請保生大帝香火至本宮奉祀，有感於神威顯赫，保境安民，即刻金身開光奉祀至咸豐元年〈西仍1851年〉。在大港庄中擇地興建廟宇，竣工後定名為大港保安宮 惟民國26年〈日據時代〉因實施都市計畫分成兩庄 至民國四十八年拆除舊廟重建廟宇至五十七年三月完工，民國七十六年再經重修，民國九十八年增設太歲殿文昌殿