宮主因與五年千歲中的侯府千歲有緣，分靈杉林鎮安宮五年千歲中的侯府千歲，於民國94年（2005）在赤崁現址創宮，主祀侯府千歲，經常於夜晚濟世，曾分別至高雄杉林鎮安宮、湖西鄉南寮保安宮和雲林馬鳴山鎮安宮進香交流。民國111年（2022）進行修繕成今貌。