確切創建年代不詳，日治時期由望安山寮許允清捐資興建，由於南坪一帶為東、西安兩村主要的墓葬區，乃借助萬善爺的威力來鎮壓穢氣與「萬善同歸所」，以確保社里平安。
由宮內文物可知萬善宮於民國60年(1971)重建，今貌則為民國92年(2023)重修而成。