濟公廟原為一貫道正義輔導委員會組線的佛堂，於民國35年（1946）從上海傳入澎湖，當時因為受到政府禁止打壓，一開始只能在私下秘密活動，至民國49年（1960），由來澎湖服役的丁豐林求道而開端，並發展出眾多家庭佛壇，壇號常冠以「天」字，而濟公廟即為天炯佛堂。
民國57年（1968）開始募款籌建佛堂，以濟公活佛為主神，由陳尋、紀能尚兩人捐獻土地，翁大樹等人捐款，名為「濟公廟」，成為一貫道正義輔導委員會澎湖總壇，隔年(1969)落成。此後曾在民國78年（1989）重建、民國91年（2002）擴建，於民國93年（2004）再度整修落成為今貌。