1977年東石塭港村萬善同居廟主神陳主帥,降示要於臺北縣土城鄉尋找吉地建廟,作為其北部濟世之地,後起輦找到現址,並命名為萬人同廟,於1978年發起建廟,1980年廟宇硬體大致完成,舉辦入火安座。至1986年廟體及附屬建築大致完備,後陸續修建而成現貌。
為嘉義縣東石鄉萬善同居廟之分靈廟,其廟名為當時主神所降示,因此並不算是有應公廟。