彌陀寺是由俊慧法師創建，俊慧法師因佛緣而出家禮佛，後回家中創立南山精舍，乃南州鄉內首座佛寺，後參佛修法信眾日增，因而將居家改建為佛寺，幸承蒙善信捐輸鳩工，於民國八十年（西元一九九一年歲次辛未年）改建竣工，並舉行安座大典。